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贝瑞基因三代“地贫”取得临床应用重大进步发表时间:2023-02-16 20:36 近日,由中南大学医学遗传学研究中心邬玲仟教授和梁德生教授课题组牵头、贝瑞基因(000710)提供技术支持的三代测序地中海贫血基因检测技术多中心产前诊断临床研究成果,发表于检验医学权威国际期刊CLINICALCHEMISTRY(影响因子12.167)。 针对这一分子遗传学重要成果,CLINICALCHEMISTRY专门发表编辑部评论文章并给予高度评价,彰显了三代测序技术为复杂单基因病的分子诊断带来的全新机遇,以及在临床应用上的巨大价值及广阔前景。 资深专家高度评价:产前诊断应用场景优势明显 该多中心临床研究主要针对地中海贫血(简称“地贫”)。由于目前尚无有效治疗中间型或重型地贫的方法,产前诊断成为预防此类出生缺陷的有效手段。 以α、β-地贫为典型代表的复杂单基因病,在胎儿期不具备完整的可观测的临床表型,故分子检测结果的精准性以及极高的阳性预测值(PPV)对于产前诊断的决策至关重要。加上地贫基因的高度同源性及变异的复杂多样性,传统PCR方法和短读长的二代测序(NGS)方法并不是检测的最佳方法。 此次研究分别基于传统PCR和CATSA ( ComprehensiveAnalysisofThalassemiaAleles)方法对来自11个研究中心的278例高危妊娠羊膜穿刺术样本进行了双盲背靠背研究。PCR检测出191个胎儿携带地贫变异基因,CATSA准确地识别出206个胎儿携带地贫变异基因。结果不一致样本进一步采用Sanger测序等技术验证,最终证实CATSA检测结果准确性为100%。与PCR方法学相比,CATSA方法阳性检出率显著提高(7.9%,15/191),其中PCR方法在检测范围内出现4例假阴/假阳性结果。另外,CATSA方法还在11例样本中多检出有临床意义的地贫基因变异。值得注意的是,CATSA检测结果修正了8个胎儿的表型预测结果,其中一个胎儿因为传统PCR方法误诊 (PCR方法提示为HBBc.52A>T纯合变异,CATSA方法结果为HBBc.52A>T杂合变异)导致被错误终止妊娠的遗憾结局。 来自麻省理工学院和哈佛大学布罗德学院的两位资深专家KatherineA.Laf-ferty和DianaM.Toledo同期撰文对该项临床研究予以高度评价。 基于三代测序的创新性基因诊断方法相较于常规基于PCR方法,有效提高了地贫基因检测的灵敏度、特异性、PPV和NPV,是临床应用效能的重大进步。基于CATSA方法在地贫产前诊断应用场景中的明显优势,地贫产前诊断分子检测应提倡采用CASTA方法联合检测解决方案,以便于得到一个完整准确的结果。因为当一个家庭面对自己的妊娠做出决定的时刻,假阳性或假阴性结果会造成极大的不良后果。 三代测序先发布局 得益于高保真、长读长的三代测序技术,8%的人类基因组复杂区域终被攻克。2022年4月,被誉为生命科学“登月计划”的人类基因组测序也迎来了完整无间隙的序列,为整个基因行业打开了一扇全新的大门。 而贝瑞基因在三代测序领域的布局也早已开启,遵循科研先行、硬件提速、产品落地的原则,为打造三代测序筛查“中国方案”进行不懈探索。截至2022年底,贝瑞基因累计服务三代测序检测样本量突破10万人份,服务终端客户超过1500家。 开展多项重磅临床研究的同时,贝瑞基因在三代测序仪上实现自主可控,拥有雄厚储备。在此基础上,公司落地了三代地贫、三代CAH(先天性肾上腺皮质增生症)、三代SMA(脊髓性肌萎缩症)、三代FXS(脆性X综合征)等产品,并均取得发明专利证书。 值得一提的是,贝瑞基因福州数字生命产业园已完成三代测序应用转化中心建设。以此为载体,贝瑞基因将向更多复杂基因变异疾病发起挑战,力求在单基因全病种的检测上做到精准“一键解决”。 |